Film Miracle in Cell No 7 menceritakan tentang Dodo Rozak yang berusaha menjadi ayah yang baik bagi putrinya.
Walaupun ia merupakan pria dengan kecerdasan terbatas, bertingkah dan berperilaku seperti anak-anak.
Kartika bangga pada ayahnya yang berjualan balon sehari-harinya. Tapi kebahagiaan mereka tidak berlangsung lama ketika keduanya harus dipisahkan.
Suatu ketika Dodo ditangkap atas tuduhan memperkosa dan membunuh gadis kecil bernama Melati.
Dodo dimasukkan dalam sel penjara No.7 yang dihuni oleh napi-napi beringas lainnya (Indro Warkop, Tora Sudiro, Bryan Domani, Indra Jegel, Rigen).
Setelah berbagai peristiwa yang dialami Dodo di penjara, Dodo berhasil mendapatkan bantuan untuk menyelundupkan Kartika ke dalam selnya.
Kedekatan Dodo dan Kartika menularkan kebahagiaan bagi napi dan sipir di Penjara.
Melihat kedekatan Dodo dengan putrinya tersebut, mereka mulai ragu apakah pria penyayang seperti Dodo, tega membunuh Melati.